全港周日（11日）多處發生示威者與警察衝突，其中防暴警曾攻入葵芳站，與示威者爆發衝突，期間一度在站內發射橡膠子彈及催淚彈等。
港鐵凌晨發聲明指，周日（11日）晚約8時50分，警方在葵芳站大堂與示威人士發生衝突，警方在進行驅散行動時，一度發放橡膠子彈及催淚彈等，由於當時站內有乘客和港鐵職員，有關事件及行動極有可能影響他們的安全，對此表示非常遺憾，港鐵已就此向警方表示非常關注，並促請警方於執法期間必須先顧及港鐵員工及乘客的安全。
港鐵解釋，當時車站職員當時見站內有煙，基於乘客及車站職員安全考慮，於是啟動疏散程序。同時，車務控制中心亦即時指示荃灣綫列車來回方向不停葵芳站，同時安排特別列車接載站內乘客離開。及至睌上10時35分左右，車務控制中心鑑於站內所有乘客已離開車站，於是決定關閉車站，以便詳細檢查及維修站內設施，務求車站周一可提供正常車務運作。
而港鐵在聲明中強調，乘客和職員的安全是其首要考慮，勸喻大家顧己及人，並且讉責一切暴力行為。同時，已就事件向警方表示非常關注，並促請警方於執法期間，必須先顧及港鐵員工及乘客的安全。
